No segundo semestre de 2003, um grupo de estudantes e a coordenação do curso de Administração da FMR-SP se viram motivados pela idéia do "Projeto Empresa Júnior", que atenderia as suas aspirações quanto a possibilidade de adquirir um complemento prático à formação teórica a partir da prestação de serviços de consultoria a organizações.
Sendo assim, no início de outubro de 2003 os alunos iniciaram um processo de pesquisa junto as Federações existentes e adquiriram o "KNOW-HOW" de como criar uma Empresa Júnior na FMR - SP.
A partir desse momento, formou-se um grupo de estudos que deu início ao processo de criação que culminou na fundação Empresa Júnior da FMR - SP de São Manuel em 1 de novembro de 2003.
Nesta data, foi eleita uma Diretoria Provisória, para que pudessem dar prosseguimento às atividades de regulamentação da recente Empresa Júnior. Esta diretoria teve mandato até 12 de novembro, quando foi eleita, pelos alunos do curso de Administração Gera, Administração com Habilidade em Marketing e Administração com Habilidade em Comércio Exterior da FMR - SP, em assembléia geral, a primeira diretoria executiva e seu respectivo conselho de administração ambos com mandato de dois anos para a primeira gestão.